Omicron Munculkan Banyak Sub-Varian, Tanda Virus Bermutasi Lebih Cepat?

Karena Omicron telah menyebar dengan cepat, dan memiliki banyak kesempatan untuk bermutasi, Omicron juga memperoleh mutasi spesifiknya sendiri. Ini telah memunculkan beberapa sub-garis keturunan, atau sub-varian.

Dua yang pertama diberi label BA.1 dan BA.2. Daftar saat ini sekarang juga mencakup BA.1.1, BA.3, BA.4 dan BA.5.

“Kami memang melihat sub-varian dari versi virus sebelumnya, seperti Delta. Namun, Omicron telah mengungguli ini, berpotensi karena peningkatan transmisibilitasnya. Jadi sub-varian dari varian virus sebelumnya jauh lebih jarang saat ini dan kurang ditekankan untuk melacaknya.”

Ada bukti bahwa sub-varian Omicron ini – khususnya BA.4 dan BA.5 – sangat efektif untuk menginfeksi ulang orang dengan infeksi sebelumnya dari BA.1 atau garis keturunan lainnya. Ada juga kekhawatiran bahwa sub-varian ini dapat menginfeksi orang yang telah divaksinasi.

“Jadi kami memperkirakan akan melihat peningkatan pesat dalam kasus COVID-19 dalam beberapa minggu dan bulan mendatang karena infeksi ulang, yang sudah kami lihat di Afrika Selatan,” kata Doherty.

Namun, lanjut Doherty, penelitian terbaru menunjukkan dosis ketiga vaksin COVID-19 adalah cara paling efektif untuk memperlambat penyebaran Omicron (termasuk sub-varian). Serta efektif mencegah rawat inap terkait COVID-19 di rumah sakit.

Baru-baru ini, BA.2.12.1 juga menarik perhatian karena telah menyebar dengan cepat di Amerika Serikat dan baru-baru ini terdeteksi dalam air limbah di Australia.

Yang mengkhawatirkan, bahkan jika seseorang telah terinfeksi dengan sub-varian Omicron BA.1, reinfeksi masih mungkin terjadi dengan sub-garis keturunan BA.2, BA.4 dan BA.5 karena kapasitas mereka untuk menghindari respons imun.

“Anda akan berpikir SARS-CoV-2 adalah yang terdepan dalam hal mutasi. Tetapi virus ini sebenarnya bermutasi relatif lambat. Virus influenza, misalnya, bermutasi setidaknya empat kali lebih cepat.”

Namun, SARS-CoV-2 memiliki "sprint mutasi" untuk waktu yang singkat, menurut penelitian Doherty. Selama salah satu sprint ini, virus dapat bermutasi empat kali lipat lebih cepat dari biasanya selama beberapa minggu.

Setelah sprint seperti itu, garis keturunan memiliki lebih banyak mutasi, beberapa di antaranya dapat memberikan keuntungan dibandingkan garis keturunan lainnya.

Contohnya termasuk mutasi yang dapat membantu virus menjadi lebih menular, menyebabkan penyakit yang lebih parah, atau menghindari respons kekebalan tubuh, dan dengan demikian muncul varian baru.

Virus mengalami sprint mutasi yang mengarah pada munculnya varian tidak jelas masih menjadi pertanyaan. Tetapi ada dua teori utama tentang asal usul Omicron dan bagaimana ia mengumpulkan begitu banyak mutasi.

Pertama, virus dapat berkembang pada infeksi kronis (berkepanjangan) pada orang yang mengalami imunosupresi (memiliki sistem kekebalan yang lemah).

Kedua, virus bisa saja “melompat” ke spesies lain, sebelum menginfeksi manusia lagi.

Mutasi bukan satu-satunya cara varian bisa muncul. Varian Omicron XE tampaknya dihasilkan dari peristiwa rekombinasi. Di sinilah satu pasien terinfeksi BA.1 dan BA.2 secara bersamaan. Koinfeksi ini menyebabkan "pertukaran genom" dan varian hibrida.

Contoh rekombinasi lain dalam SARS-CoV-2 telah dilaporkan antara Delta dan Omicron, menghasilkan apa yang disebut Deltacron.

Sejauh ini, resolusi rekombinan tidak memiliki transmisibilitas yang lebih tinggi atau menyebabkan hasil yang lebih parah. Tapi ini bisa berubah dengan cepat dengan rekombinan baru. Jadi para ilmuwan meneliti mereka dengan cermat.

“Selama virus tersebut beredar, kita akan terus melihat garis keturunan dan varian virus baru. Karena Omicron adalah varian yang paling umum saat ini, kemungkinan kita akan melihat lebih banyak sub-varian Omicron, dan mungkin garis keturunan rekombinan.”

Para ilmuwan akan terus melacak mutasi baru dan peristiwa rekombinasi (terutama dengan sub-varian). Mereka juga akan menggunakan teknologi genomik untuk memprediksi bagaimana ini mungkin terjadi dan efek apa yang mungkin mereka miliki terhadap perilaku virus.

“Pengetahuan ini akan membantu kami membatasi penyebaran dan dampak varian dan sub-varian. Ini juga akan memandu pengembangan vaksin yang efektif terhadap banyak varian atau varian tertentu,” tutup Doherty.