Mengenal PCR-SGTF untuk Deteksi Ashanty yang Positif Covid-19, Begini Cara Kerjanya

Kita sudah sering mendengar istilah PCR (Polymerase Chain Reaction) untuk mendeteksi virus Covid-19 di dalam tubuh kita. Kini ada metode baru dan lebih mendetail untuk mendeteksi virus Covid-19. Metode itu disebut dengan WGS dan SGTF. 

SGTF singkatan dari S-Gene target failure yang merupakan teknologi RNS untuk melakukan pemeriksaan probable omicron. Penggunaan teknologi PCR-SGTF diklaim dapat menunjukkan indikasi awal positif omicron. Cara kerja PCR-SGTF untuk mendeteksi virus omicron dilakukan ketika gen S pada hasil tes laboratorium menggunakan PCR tak mampu mendeteksi gen S pada sampel. 

Saat ini penggunaan PCR-SGTF atau pemeriksaan menggunakan PCR-SGTF masih terbatas. PCR-SGTF diberlakukan baru di setiap pintu masuk bandara antar negara untuk mendeteksi varian omicron yang mungkin terbawa oleh pelancong dari luar negeri ke Indonesia. 

PCR SGTF bertujuan untuk skrining awal keberadaan virus covid-19. Seperti yang diketahui covid-19 bermutasi menjadi beberapa varian, yang terbaru adalah varian omicron. Munculnya Omicron baru-baru ini, membuat semua pihak dan individu di berbagai negara menjadi lebih responsif pada kemungkinan penyebarannya yang meluas. 

Dikutip dari CNNIndonesia, Guru Besar Fakultas Kedokteran dari Universitas Indonesia (FKUI) Tjandra Yoga Aditama menjelaskan cara kerja metode S Gene Target Failure (SGTF) untuk mendeteksi Covid-19 varian Omicron atau varian B.1.1.529. Metode SGTF bisa dilakukan ketika Gen S pada hasil test laboratorium menggunakan Polymerase chain reaction (PCR) tak mampu mendeteksi gen S pada sampel.

"Jadi PCR itu memang memeriksa beberapa gene, kalau kita test pcr kan itu terlihat gene ini angkanya sekian, rata-rata angkanya sekian. Nah kalau SGTF ini (gen) Snya tidak bisa terdeteksi," ujar Tjandra.

Tjandra menjelaskan apabila individu melakukan tes PCR, biasanya akan ada hasil angka yang menunjukkan informasi CT Value, terdiri dari keterangan gen pada sampel yang diambil. Apabila hasil dari PCR itu tidak mendeteksi adanya gen S, maka individu tersebut dianjurkan untuk melakukan proses pengecekan Whole Genome Sequencing (WGS).

"Jadi Gen S itu tidak terdeteksi dites PCR di laboratorium. Kalau Anda pernah test PCR maka hasil pemeriksaanya keluar beberapa angka, Misalnya rata-rata CT value itu 25, itu terdiri dari gen ini sekian gen ini sekian," pungkasnya.

Dari hasil PCR yang tidak terdeteksi adanya Gen S itu, kata Tjandra seseorang patut dicurigai bahwa individu tersebut terpapar varian Omicron. Kemudian, untuk memastikannya perlu dilakukan tes WGS.

"Tapi kalau orangnya datang dari Afsel enggak usah nunggu PCR lagi, langsung saja WGS," tandasnya.

Ahli Biologi Molekuler Ahmad Rusdan Utomo merespons pernyataan Menteri Kesehatan Budi Gunawan menjelaskan soal hasil tes PCR Covid-19 dengan metode S Gene Target Failure (SGTF) dapat keluar dalam rentang 4-5 jam pasca pengambilan sampel.

Menurut Rusdan hal tersebut sangat lumrah lantaran metode yang digunakan sengaja difokuskan terhadap area genome varian Omicron atau varian B.1.1.529 di Indonesia.

"Bisa lebih cepat, karena teknik SGTF sudah fokus ke area genome si Omicron yang kehilangan (atau delesi) beberapa huruf genetik di gen S (spike)," kata Ahmad melalui pesan singkat kepada wartawan, Selasa (21/12).

Ia menjelaskan area ter-delete pada gen S sebelumnya memang tidak rutin diperiksa. Rusdan menyebut di laboratorium Indonesia umumnya pemeriksaan hanya kepada gen N dan gen ORF.

"Sejauh ini area yang ter-delete ini memang umumnya ditemukan di Omicron, tidak di Delta misalnya. Maka ketika teknik SGFT ini positif ya kemungkinan besar Omicron," ujar dia.

Ia juga menyebut teknik SGTF tersebut tidak perlu menggunakan mesin Nextgen Sequencing lagi, melainkan dapat menggunakan mesin RT-PCR yang umumnya sudah ada.